Os procuradores da Procuradoria Especial da Marinha atuam nos diversos processos sobre acidentes e fatos da navegação que serão posteriormente julgados no Tribunal Marítimo. Assim, quando os acidentes e fatos da navegação dão entrada na PEM – oriundas da diversas Capitanias e delegacias do Brasil -, os procuradores, eles podem optar em fazer uma representação – que equivale a à denúncia no Ministério Público – , pedir arquivamentos, oferecer alegações finais, produzir provas ou requerer diligências. Enfim, eles atuam em todas as fases do processo. Além disso, os procuradores na PEM, eles têm uma atividade cartorária porque eles opinam em todos os registros de armadores, de propriedade de embarcações marítimas e o registro especial brasileiro.
